Toolyard

Situs Pengenalan ApaLI


Ringkasan ApaLI

5' G|TGCAC 3'
3' CACGT|G 5'
Situs pengenalan5'-GTGCAC-3'
PotonganG^TGCAC
Ujungujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (TGCA)
Frekuensi perkiraansekitar sekali setiap 4.096 bp pada DNA acak

Cara menemukan situs ApaLI dalam sekuens

  1. Tempel sekuens DNA atau rekaman FASTA di kotak di atas. ApaLI sudah terisi di Hanya enzim ini.
  2. Centang DNA sirkular untuk plasmid, agar situs yang melintasi ujung dan awal sekuens juga ditemukan.
  3. Peta menandai setiap potongan ApaLI beserta posisinya. Salin atau unduh hasil di bawahnya.

Pertanyaan umum

Sekuens apa yang dipotong ApaLI?

ApaLI mengenali GTGCAC (ditulis dari 5' ke 3') dan memotong untai atas di G^TGCAC.

Apakah ApaLI menghasilkan ujung lengket atau tumpul?

Ujung lengket: ujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (TGCA).

Seberapa sering ApaLI memotong?

Situs seperti GTGCAC muncul sekitar sekali setiap 4.096 bp pada DNA acak. Sekuens nyata bervariasi, jadi periksa sekuens Anda di atas.

Enzim restriksi

Alat sekuens DNA dan protein lainnya

Panduan