Toolyard

Situs Pengenalan PvuI


Ringkasan PvuI

5' CGAT|CG 3'
3' GC|TAGC 5'
Situs pengenalan5'-CGATCG-3'
PotonganCGAT^CG
Ujungujung 3' menggantung sepanjang 2 basa (AT)
Frekuensi perkiraansekitar sekali setiap 4.096 bp pada DNA acak
Ujung yang kompatibelPacI

Cara menemukan situs PvuI dalam sekuens

  1. Tempel sekuens DNA atau rekaman FASTA di kotak di atas. PvuI sudah terisi di Hanya enzim ini.
  2. Centang DNA sirkular untuk plasmid, agar situs yang melintasi ujung dan awal sekuens juga ditemukan.
  3. Peta menandai setiap potongan PvuI beserta posisinya. Salin atau unduh hasil di bawahnya.

Pertanyaan umum

Sekuens apa yang dipotong PvuI?

PvuI mengenali CGATCG (ditulis dari 5' ke 3') dan memotong untai atas di CGAT^CG.

Apakah PvuI menghasilkan ujung lengket atau tumpul?

Ujung lengket: ujung 3' menggantung sepanjang 2 basa (AT).

Enzim apa yang menghasilkan ujung yang kompatibel dengan PvuI?

PacI. Bagian menggantungnya sama, jadi ujung-ujungnya bisa diligasi satu sama lain.

Seberapa sering PvuI memotong?

Situs seperti CGATCG muncul sekitar sekali setiap 4.096 bp pada DNA acak. Sekuens nyata bervariasi, jadi periksa sekuens Anda di atas.

Enzim restriksi

Alat sekuens DNA dan protein lainnya

Panduan