Toolyard

Situs Pengenalan AvaI





Ringkasan AvaI
5' C|YCGRG 3'
3' GRGCY|C 5'


Situs pengenalan5'-CYCGRG-3'


PotonganC^YCGRG


Ujungujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (YCGR)


Frekuensi perkiraansekitar sekali setiap 1.024 bp pada DNA acak







Cara menemukan situs AvaI dalam sekuens
  1. Tempel sekuens DNA atau rekaman FASTA di kotak di atas. AvaI sudah terisi di Hanya enzim ini.
  2. Centang DNA sirkular untuk plasmid, agar situs yang melintasi ujung dan awal sekuens juga ditemukan.
  3. Peta menandai setiap potongan AvaI beserta posisinya. Salin atau unduh hasil di bawahnya.
Pertanyaan umum
Sekuens apa yang dipotong AvaI?
AvaI mengenali CYCGRG (ditulis dari 5' ke 3') dan memotong untai atas di C^YCGRG.
Apakah AvaI menghasilkan ujung lengket atau tumpul?
Ujung lengket: ujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (YCGR).
Seberapa sering AvaI memotong?
Situs seperti CYCGRG muncul sekitar sekali setiap 1.024 bp pada DNA acak. Sekuens nyata bervariasi, jadi periksa sekuens Anda di atas.



Enzim restriksi
Peta RestriksiSitus Pengenalan AatIISitus Pengenalan AccISitus Pengenalan AflIISitus Pengenalan AgeISitus Pengenalan AluISitus Pengenalan ApaISitus Pengenalan ApaLISitus Pengenalan AscISitus Pengenalan AvrIISitus Pengenalan BamHISitus Pengenalan BclISitus Pengenalan BglIISitus Pengenalan BsiWISitus Pengenalan BspHISitus Pengenalan BsrGISitus Pengenalan BssHIISitus Pengenalan BstBISitus Pengenalan ClaISitus Pengenalan DraISitus Pengenalan EagISitus Pengenalan EcoRISitus Pengenalan EcoRVSitus Pengenalan FseISitus Pengenalan HaeIIISitus Pengenalan HhaISitus Pengenalan HincIISitus Pengenalan HindIIISitus Pengenalan HinfISitus Pengenalan HpaISitus Pengenalan KpnISitus Pengenalan MfeISitus Pengenalan MluISitus Pengenalan MseISitus Pengenalan MspISitus Pengenalan NaeISitus Pengenalan NcoISitus Pengenalan NdeISitus Pengenalan NheISitus Pengenalan NotISitus Pengenalan NruISitus Pengenalan NsiISitus Pengenalan PacISitus Pengenalan PmeISitus Pengenalan PstISitus Pengenalan PvuISitus Pengenalan PvuIISitus Pengenalan RsaISitus Pengenalan SacISitus Pengenalan SacIISitus Pengenalan SalISitus Pengenalan Sau3AISitus Pengenalan ScaISitus Pengenalan SfiISitus Pengenalan SmaISitus Pengenalan SnaBISitus Pengenalan SpeISitus Pengenalan SphISitus Pengenalan SspISitus Pengenalan StuISitus Pengenalan SwaISitus Pengenalan TaqISitus Pengenalan XbaISitus Pengenalan XhoISitus Pengenalan XmaI


Alat sekuens DNA dan protein lainnya


Komplemen BalikDNA ke RNAGabungkan Sekuens FASTAPecah Sekuens FASTAGenBank ke FASTAEMBL ke FASTAEkstraktor Fitur GenBankEkstraktor Fitur EMBLEkstraktor Translasi GenBankEkstraktor Translasi EMBLPecah Menjadi KodonEkstraktor Rentang DNAEkstraktor Rentang ProteinEkstraktor Jendela DNAEkstraktor Jendela ProteinBersihkan DNABersihkan ProteinKelompokkan DNAKelompokkan ProteinAsam Amino Satu ke Tiga HurufAsam Amino Tiga ke Satu HurufStatistik DNAStatistik ProteinPenggunaan KodonPencari Pulau CpGBerat Molekul DNABerat Molekul ProteinTitik Isoelektrik ProteinGRAVY ProteinCari Pola DNACari Pola ProteinPencarian Mirip DNAPencarian Mirip ProteinIdentitas dan KemiripanPencari ORFTranslasi DNA ke ProteinTranslasi BalikTranslasi Balik Penyejajaran ProteinStatistik Primer PCRProduk PCRRingkasan RestriksiMutasi untuk DigestiSejajarkan Dua DNASejajarkan Dua ProteinSejajarkan KodonOptimasi KodonPencari Pemandu CRISPRPeta TranslasiPeta PrimerWarnai Penyejajaran Menurut KonservasiWarnai Penyejajaran Menurut SifatPlot KodonPenampil Peta PlasmidSekuens DNA AcakSekuens Protein AcakDNA Penyandi AcakWilayah DNA AcakWilayah Protein AcakSampel DNASampel ProteinAcak Urutan DNAAcak Urutan ProteinMutasikan DNAMutasikan ProteinKode GenetikKode IUPAC


Panduan


Cara Menemukan Situs Restriksi pada Sekuens DNACara Membaca Peta PlasmidCara Merancang RNA Pemandu CRISPR