Toolyard

Situs Pengenalan NcoI


Ringkasan NcoI

5' C|CATGG 3'
3' GGTAC|C 5'
Situs pengenalan5'-CCATGG-3'
PotonganC^CATGG
Ujungujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (CATG)
Frekuensi perkiraansekitar sekali setiap 4.096 bp pada DNA acak
Ujung yang kompatibelBspHI

Cara menemukan situs NcoI dalam sekuens

  1. Tempel sekuens DNA atau rekaman FASTA di kotak di atas. NcoI sudah terisi di Hanya enzim ini.
  2. Centang DNA sirkular untuk plasmid, agar situs yang melintasi ujung dan awal sekuens juga ditemukan.
  3. Peta menandai setiap potongan NcoI beserta posisinya. Salin atau unduh hasil di bawahnya.

Pertanyaan umum

Sekuens apa yang dipotong NcoI?

NcoI mengenali CCATGG (ditulis dari 5' ke 3') dan memotong untai atas di C^CATGG.

Apakah NcoI menghasilkan ujung lengket atau tumpul?

Ujung lengket: ujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (CATG).

Enzim apa yang menghasilkan ujung yang kompatibel dengan NcoI?

BspHI. Bagian menggantungnya sama, jadi ujung-ujungnya bisa diligasi satu sama lain.

Seberapa sering NcoI memotong?

Situs seperti CCATGG muncul sekitar sekali setiap 4.096 bp pada DNA acak. Sekuens nyata bervariasi, jadi periksa sekuens Anda di atas.

Enzim restriksi

Alat sekuens DNA dan protein lainnya

Panduan