NcoI-Erkennungssequenz
NcoI auf einen Blick
5' C|CATGG 3' 3' GGTAC|C 5'
| Erkennungssequenz | 5'-CCATGG-3' |
| Schnitt | C^CATGG |
| Enden | überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (CATG) |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA |
| Kompatible Enden | BspHI |
So findest du NcoI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. NcoI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden NcoI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet NcoI?
NcoI erkennt CCATGG (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei C^CATGG.
Erzeugt NcoI klebrige oder glatte Enden?
Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (CATG).
Welche Enzyme erzeugen zu NcoI kompatible Enden?
BspHI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.
Wie oft schneidet NcoI?
Eine Sequenz wie CCATGG kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
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