AatII-Erkennungssequenz
AatII auf einen Blick
5' GACGT|C 3' 3' C|TGCAG 5'
| Erkennungssequenz | 5'-GACGTC-3' |
| Schnitt | GACGT^C |
| Enden | überhängende 3'-Enden mit 4 Basen (ACGT) |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA |
So findest du AatII-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. AatII steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden AatII-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet AatII?
AatII erkennt GACGTC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei GACGT^C.
Erzeugt AatII klebrige oder glatte Enden?
Klebrige Enden: überhängende 3'-Enden mit 4 Basen (ACGT).
Wie oft schneidet AatII?
Eine Sequenz wie GACGTC kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
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