AgeI-Erkennungssequenz

AgeI auf einen Blick

5' A|CCGGT 3'
3' TGGCC|A 5'

So findest du AgeI-Schnittstellen in einer Sequenz

1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. AgeI steht schon unter Nur diese Enzyme.
2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
3. Die Karte markiert jeden AgeI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet AgeI?

AgeI erkennt ACCGGT (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei A^CCGGT.

Erzeugt AgeI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (CCGG).

Welche Enzyme erzeugen zu AgeI kompatible Enden?

XmaI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet AgeI?

Eine Sequenz wie ACCGGT kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.