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EcoRV-Erkennungssequenz


EcoRV auf einen Blick

5' GAT|ATC 3'
3' CTA|TAG 5'
Erkennungssequenz5'-GATATC-3'
SchnittGAT^ATC
Endenglatte Enden
Erwartete Häufigkeitetwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA

So findest du EcoRV-Schnittstellen in einer Sequenz

  1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. EcoRV steht schon unter Nur diese Enzyme.
  2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
  3. Die Karte markiert jeden EcoRV-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet EcoRV?

EcoRV erkennt GATATC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei GAT^ATC.

Erzeugt EcoRV klebrige oder glatte Enden?

Glatte Enden ohne Überhang.

Wie oft schneidet EcoRV?

Eine Sequenz wie GATATC kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.

Restriktionsenzyme

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