SacI-Erkennungssequenz
SacI auf einen Blick
5' GAGCT|C 3' 3' C|TCGAG 5'
| Erkennungssequenz | 5'-GAGCTC-3' |
| Schnitt | GAGCT^C |
| Enden | überhängende 3'-Enden mit 4 Basen (AGCT) |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA |
So findest du SacI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. SacI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden SacI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet SacI?
SacI erkennt GAGCTC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei GAGCT^C.
Erzeugt SacI klebrige oder glatte Enden?
Klebrige Enden: überhängende 3'-Enden mit 4 Basen (AGCT).
Wie oft schneidet SacI?
Eine Sequenz wie GAGCTC kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
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