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BglII-Erkennungssequenz


BglII auf einen Blick

5' A|GATCT 3'
3' TCTAG|A 5'
Erkennungssequenz5'-AGATCT-3'
SchnittA^GATCT
Endenüberhängende 5'-Enden mit 4 Basen (GATC)
Erwartete Häufigkeitetwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA
Kompatible EndenBamHI, BclI, Sau3AI

So findest du BglII-Schnittstellen in einer Sequenz

  1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. BglII steht schon unter Nur diese Enzyme.
  2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
  3. Die Karte markiert jeden BglII-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet BglII?

BglII erkennt AGATCT (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei A^GATCT.

Erzeugt BglII klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (GATC).

Welche Enzyme erzeugen zu BglII kompatible Enden?

BamHI, BclI und Sau3AI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet BglII?

Eine Sequenz wie AGATCT kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.

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