KpnI-Erkennungssequenz
KpnI auf einen Blick
5' GGTAC|C 3' 3' C|CATGG 5'
| Erkennungssequenz | 5'-GGTACC-3' |
| Schnitt | GGTAC^C |
| Enden | überhängende 3'-Enden mit 4 Basen (GTAC) |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA |
So findest du KpnI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. KpnI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden KpnI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet KpnI?
KpnI erkennt GGTACC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei GGTAC^C.
Erzeugt KpnI klebrige oder glatte Enden?
Klebrige Enden: überhängende 3'-Enden mit 4 Basen (GTAC).
Wie oft schneidet KpnI?
Eine Sequenz wie GGTACC kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
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