NaeI-Erkennungssequenz
NaeI auf einen Blick
5' GCC|GGC 3' 3' CGG|CCG 5'
| Erkennungssequenz | 5'-GCCGGC-3' |
| Schnitt | GCC^GGC |
| Enden | glatte Enden |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA |
So findest du NaeI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. NaeI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden NaeI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet NaeI?
NaeI erkennt GCCGGC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei GCC^GGC.
Erzeugt NaeI klebrige oder glatte Enden?
Glatte Enden ohne Überhang.
Wie oft schneidet NaeI?
Eine Sequenz wie GCCGGC kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
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