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SalI-Erkennungssequenz


SalI auf einen Blick

5' G|TCGAC 3'
3' CAGCT|G 5'
Erkennungssequenz5'-GTCGAC-3'
SchnittG^TCGAC
Endenüberhängende 5'-Enden mit 4 Basen (TCGA)
Erwartete Häufigkeitetwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA
Kompatible EndenXhoI

So findest du SalI-Schnittstellen in einer Sequenz

  1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. SalI steht schon unter Nur diese Enzyme.
  2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
  3. Die Karte markiert jeden SalI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet SalI?

SalI erkennt GTCGAC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei G^TCGAC.

Erzeugt SalI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (TCGA).

Welche Enzyme erzeugen zu SalI kompatible Enden?

XhoI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet SalI?

Eine Sequenz wie GTCGAC kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.

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