NotI-Erkennungssequenz

NotI auf einen Blick

5' GC|GGCCGC 3'
3' CGCCGG|CG 5'

So findest du NotI-Schnittstellen in einer Sequenz

1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. NotI steht schon unter Nur diese Enzyme.
2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
3. Die Karte markiert jeden NotI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet NotI?

NotI erkennt GCGGCCGC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei GC^GGCCGC.

Erzeugt NotI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (GGCC).

Welche Enzyme erzeugen zu NotI kompatible Enden?

EagI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet NotI?

Eine Sequenz wie GCGGCCGC kommt etwa einmal alle 65.536 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.