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HaeIII-Erkennungssequenz


HaeIII auf einen Blick

5' GG|CC 3'
3' CC|GG 5'
Erkennungssequenz5'-GGCC-3'
SchnittGG^CC
Endenglatte Enden
Erwartete Häufigkeitetwa einmal alle 256 bp in zufälliger DNA

So findest du HaeIII-Schnittstellen in einer Sequenz

  1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. HaeIII steht schon unter Nur diese Enzyme.
  2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
  3. Die Karte markiert jeden HaeIII-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet HaeIII?

HaeIII erkennt GGCC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei GG^CC.

Erzeugt HaeIII klebrige oder glatte Enden?

Glatte Enden ohne Überhang.

Wie oft schneidet HaeIII?

Eine Sequenz wie GGCC kommt etwa einmal alle 256 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.

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