SspI-Erkennungssequenz

SspI auf einen Blick

5' AAT|ATT 3'
3' TTA|TAA 5'

So findest du SspI-Schnittstellen in einer Sequenz

1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. SspI steht schon unter Nur diese Enzyme.
2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
3. Die Karte markiert jeden SspI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet SspI?

SspI erkennt AATATT (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei AAT^ATT.

Erzeugt SspI klebrige oder glatte Enden?

Glatte Enden ohne Überhang.

Wie oft schneidet SspI?

Eine Sequenz wie AATATT kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.