SfiI-Erkennungssequenz
SfiI auf einen Blick
5' GGCCNNNN|NGGCC 3' 3' CCGGN|NNNNCCGG 5'
| Erkennungssequenz | 5'-GGCCNNNNNGGCC-3' |
| Schnitt | GGCCNNNN^NGGCC |
| Enden | überhängende 3'-Enden mit 3 Basen (NNN) |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 65.536 bp in zufälliger DNA |
So findest du SfiI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. SfiI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden SfiI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet SfiI?
SfiI erkennt GGCCNNNNNGGCC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei GGCCNNNN^NGGCC.
Erzeugt SfiI klebrige oder glatte Enden?
Klebrige Enden: überhängende 3'-Enden mit 3 Basen (NNN).
Wie oft schneidet SfiI?
Eine Sequenz wie GGCCNNNNNGGCC kommt etwa einmal alle 65.536 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
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