Site de reconnaissance de SfiI
SfiI en bref
5' GGCCNNNN|NGGCC 3' 3' CCGGN|NNNNCCGG 5'
| Site de reconnaissance | 5'-GGCCNNNNNGGCC-3' |
| Coupure | GGCCNNNN^NGGCC |
| Extrémités | une extrémité 3' sortante de 3 bases (NNN) |
| Fréquence attendue | environ une fois toutes les 65 536 pb dans un ADN aléatoire |
Comment trouver les sites SfiI dans une séquence
- Collez une séquence d'ADN ou un enregistrement FASTA dans le champ ci-dessus. SfiI est déjà saisi dans Seulement ces enzymes.
- Cochez ADN circulaire pour un plasmide, afin de trouver aussi un site à cheval sur la fin et le début.
- La carte indique chaque coupure SfiI avec sa position. Copiez ou téléchargez le résultat en dessous.
Questions fréquentes
Quelle séquence SfiI coupe-t-elle ?
SfiI reconnaît GGCCNNNNNGGCC (écrite de 5' vers 3') et coupe le brin supérieur en GGCCNNNN^NGGCC.
SfiI laisse-t-elle des extrémités cohésives ou franches ?
Des extrémités cohésives : une extrémité 3' sortante de 3 bases (NNN).
À quelle fréquence SfiI coupe-t-elle ?
Un site comme GGCCNNNNNGGCC apparaît environ une fois toutes les 65 536 pb dans un ADN aléatoire. Les vraies séquences varient : vérifiez la vôtre ci-dessus.
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