Site de reconnaissance de EagI
EagI en bref
5' C|GGCCG 3' 3' GCCGG|C 5'
| Site de reconnaissance | 5'-CGGCCG-3' |
| Coupure | C^GGCCG |
| Extrémités | une extrémité 5' sortante de 4 bases (GGCC) |
| Fréquence attendue | environ une fois toutes les 4 096 pb dans un ADN aléatoire |
| Extrémités compatibles | NotI |
Comment trouver les sites EagI dans une séquence
- Collez une séquence d'ADN ou un enregistrement FASTA dans le champ ci-dessus. EagI est déjà saisi dans Seulement ces enzymes.
- Cochez ADN circulaire pour un plasmide, afin de trouver aussi un site à cheval sur la fin et le début.
- La carte indique chaque coupure EagI avec sa position. Copiez ou téléchargez le résultat en dessous.
Questions fréquentes
Quelle séquence EagI coupe-t-elle ?
EagI reconnaît CGGCCG (écrite de 5' vers 3') et coupe le brin supérieur en C^GGCCG.
EagI laisse-t-elle des extrémités cohésives ou franches ?
Des extrémités cohésives : une extrémité 5' sortante de 4 bases (GGCC).
Quelles enzymes laissent des extrémités compatibles avec EagI ?
NotI. Leurs extrémités sortantes sont identiques, donc elles peuvent être liguées entre elles.
À quelle fréquence EagI coupe-t-elle ?
Un site comme CGGCCG apparaît environ une fois toutes les 4 096 pb dans un ADN aléatoire. Les vraies séquences varient : vérifiez la vôtre ci-dessus.
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