XbaI-Erkennungssequenz

XbaI auf einen Blick

5' T|CTAGA 3'
3' AGATC|T 5'

So findest du XbaI-Schnittstellen in einer Sequenz

1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. XbaI steht schon unter Nur diese Enzyme.
2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
3. Die Karte markiert jeden XbaI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet XbaI?

XbaI erkennt TCTAGA (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei T^CTAGA.

Erzeugt XbaI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (CTAG).

Welche Enzyme erzeugen zu XbaI kompatible Enden?

AvrII, NheI und SpeI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet XbaI?

Eine Sequenz wie TCTAGA kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.