FseI-Erkennungssequenz
FseI auf einen Blick
5' GGCCGG|CC 3' 3' CC|GGCCGG 5'
| Erkennungssequenz | 5'-GGCCGGCC-3' |
| Schnitt | GGCCGG^CC |
| Enden | überhängende 3'-Enden mit 4 Basen (CCGG) |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 65.536 bp in zufälliger DNA |
So findest du FseI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. FseI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden FseI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet FseI?
FseI erkennt GGCCGGCC (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei GGCCGG^CC.
Erzeugt FseI klebrige oder glatte Enden?
Klebrige Enden: überhängende 3'-Enden mit 4 Basen (CCGG).
Wie oft schneidet FseI?
Eine Sequenz wie GGCCGGCC kommt etwa einmal alle 65.536 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
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