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BstBI-Erkennungssequenz


BstBI auf einen Blick

5' TT|CGAA 3'
3' AAGC|TT 5'
Erkennungssequenz5'-TTCGAA-3'
SchnittTT^CGAA
Endenüberhängende 5'-Enden mit 2 Basen (CG)
Erwartete Häufigkeitetwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA
Kompatible EndenClaI, MspI, TaqI

So findest du BstBI-Schnittstellen in einer Sequenz

  1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. BstBI steht schon unter Nur diese Enzyme.
  2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
  3. Die Karte markiert jeden BstBI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet BstBI?

BstBI erkennt TTCGAA (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei TT^CGAA.

Erzeugt BstBI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 2 Basen (CG).

Welche Enzyme erzeugen zu BstBI kompatible Enden?

ClaI, MspI und TaqI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet BstBI?

Eine Sequenz wie TTCGAA kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.

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