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BsiWI-Erkennungssequenz


BsiWI auf einen Blick

5' C|GTACG 3'
3' GCATG|C 5'
Erkennungssequenz5'-CGTACG-3'
SchnittC^GTACG
Endenüberhängende 5'-Enden mit 4 Basen (GTAC)
Erwartete Häufigkeitetwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA
Kompatible EndenBsrGI

So findest du BsiWI-Schnittstellen in einer Sequenz

  1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. BsiWI steht schon unter Nur diese Enzyme.
  2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
  3. Die Karte markiert jeden BsiWI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet BsiWI?

BsiWI erkennt CGTACG (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei C^GTACG.

Erzeugt BsiWI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (GTAC).

Welche Enzyme erzeugen zu BsiWI kompatible Enden?

BsrGI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet BsiWI?

Eine Sequenz wie CGTACG kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.

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