TaqI-Erkennungssequenz

TaqI auf einen Blick

5' T|CGA 3'
3' AGC|T 5'

So findest du TaqI-Schnittstellen in einer Sequenz

1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. TaqI steht schon unter Nur diese Enzyme.
2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
3. Die Karte markiert jeden TaqI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet TaqI?

TaqI erkennt TCGA (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei T^CGA.

Erzeugt TaqI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 2 Basen (CG).

Welche Enzyme erzeugen zu TaqI kompatible Enden?

BstBI, ClaI und MspI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet TaqI?

Eine Sequenz wie TCGA kommt etwa einmal alle 256 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.