SmaI-Erkennungssequenz
SmaI auf einen Blick
5' CCC|GGG 3' 3' GGG|CCC 5'
| Erkennungssequenz | 5'-CCCGGG-3' |
| Schnitt | CCC^GGG |
| Enden | glatte Enden |
| Erwartete Häufigkeit | etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA |
| Gleiche Sequenz | XmaI (C^CCGGG) |
So findest du SmaI-Schnittstellen in einer Sequenz
- Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. SmaI steht schon unter Nur diese Enzyme.
- Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
- Die Karte markiert jeden SmaI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.
Häufige Fragen
Welche Sequenz schneidet SmaI?
SmaI erkennt CCCGGG (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei CCC^GGG.
Erzeugt SmaI klebrige oder glatte Enden?
Glatte Enden ohne Überhang.
Wie oft schneidet SmaI?
Eine Sequenz wie CCCGGG kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.
Restriktionsenzyme
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