BspHI-Erkennungssequenz

BspHI auf einen Blick

5' T|CATGA 3'
3' AGTAC|T 5'

So findest du BspHI-Schnittstellen in einer Sequenz

1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. BspHI steht schon unter Nur diese Enzyme.
2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
3. Die Karte markiert jeden BspHI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet BspHI?

BspHI erkennt TCATGA (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei T^CATGA.

Erzeugt BspHI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 4 Basen (CATG).

Welche Enzyme erzeugen zu BspHI kompatible Enden?

NcoI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet BspHI?

Eine Sequenz wie TCATGA kommt etwa einmal alle 4.096 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.