MseI-Erkennungssequenz

MseI auf einen Blick

5' T|TAA 3'
3' AAT|T 5'

So findest du MseI-Schnittstellen in einer Sequenz

1. Füge oben eine DNA-Sequenz oder einen FASTA-Eintrag ein. MseI steht schon unter Nur diese Enzyme.
2. Setze bei einem Plasmid das Häkchen bei Zirkuläre DNA, damit auch eine Stelle über Ende und Anfang hinweg gefunden wird.
3. Die Karte markiert jeden MseI-Schnitt mit seiner Position. Das Ergebnis darunter kannst du kopieren oder herunterladen.

Häufige Fragen

Welche Sequenz schneidet MseI?

MseI erkennt TTAA (von 5' nach 3' geschrieben) und schneidet den oberen Strang bei T^TAA.

Erzeugt MseI klebrige oder glatte Enden?

Klebrige Enden: überhängende 5'-Enden mit 2 Basen (TA).

Welche Enzyme erzeugen zu MseI kompatible Enden?

NdeI. Ihre Überhänge sind gleich, daher lassen sich die Enden miteinander ligieren.

Wie oft schneidet MseI?

Eine Sequenz wie TTAA kommt etwa einmal alle 256 bp in zufälliger DNA vor. Echte Sequenzen weichen ab, prüfe deine also oben.