Toolyard

Situs Pengenalan NotI


Ringkasan NotI

5' GC|GGCCGC 3'
3' CGCCGG|CG 5'
Situs pengenalan5'-GCGGCCGC-3'
PotonganGC^GGCCGC
Ujungujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (GGCC)
Frekuensi perkiraansekitar sekali setiap 65.536 bp pada DNA acak
Ujung yang kompatibelEagI

Cara menemukan situs NotI dalam sekuens

  1. Tempel sekuens DNA atau rekaman FASTA di kotak di atas. NotI sudah terisi di Hanya enzim ini.
  2. Centang DNA sirkular untuk plasmid, agar situs yang melintasi ujung dan awal sekuens juga ditemukan.
  3. Peta menandai setiap potongan NotI beserta posisinya. Salin atau unduh hasil di bawahnya.

Pertanyaan umum

Sekuens apa yang dipotong NotI?

NotI mengenali GCGGCCGC (ditulis dari 5' ke 3') dan memotong untai atas di GC^GGCCGC.

Apakah NotI menghasilkan ujung lengket atau tumpul?

Ujung lengket: ujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (GGCC).

Enzim apa yang menghasilkan ujung yang kompatibel dengan NotI?

EagI. Bagian menggantungnya sama, jadi ujung-ujungnya bisa diligasi satu sama lain.

Seberapa sering NotI memotong?

Situs seperti GCGGCCGC muncul sekitar sekali setiap 65.536 bp pada DNA acak. Sekuens nyata bervariasi, jadi periksa sekuens Anda di atas.

Enzim restriksi

Alat sekuens DNA dan protein lainnya

Panduan