Situs Pengenalan AvrII
Ringkasan AvrII
5' C|CTAGG 3' 3' GGATC|C 5'
| Situs pengenalan | 5'-CCTAGG-3' |
| Potongan | C^CTAGG |
| Ujung | ujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (CTAG) |
| Frekuensi perkiraan | sekitar sekali setiap 4.096 bp pada DNA acak |
| Ujung yang kompatibel | NheI, SpeI, XbaI |
Cara menemukan situs AvrII dalam sekuens
- Tempel sekuens DNA atau rekaman FASTA di kotak di atas. AvrII sudah terisi di Hanya enzim ini.
- Centang DNA sirkular untuk plasmid, agar situs yang melintasi ujung dan awal sekuens juga ditemukan.
- Peta menandai setiap potongan AvrII beserta posisinya. Salin atau unduh hasil di bawahnya.
Pertanyaan umum
Sekuens apa yang dipotong AvrII?
AvrII mengenali CCTAGG (ditulis dari 5' ke 3') dan memotong untai atas di C^CTAGG.
Apakah AvrII menghasilkan ujung lengket atau tumpul?
Ujung lengket: ujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (CTAG).
Enzim apa yang menghasilkan ujung yang kompatibel dengan AvrII?
NheI, SpeI, dan XbaI. Bagian menggantungnya sama, jadi ujung-ujungnya bisa diligasi satu sama lain.
Seberapa sering AvrII memotong?
Situs seperti CCTAGG muncul sekitar sekali setiap 4.096 bp pada DNA acak. Sekuens nyata bervariasi, jadi periksa sekuens Anda di atas.
Enzim restriksi
Peta RestriksiSitus Pengenalan AatIISitus Pengenalan AccISitus Pengenalan AflIISitus Pengenalan AgeISitus Pengenalan AluISitus Pengenalan ApaISitus Pengenalan ApaLISitus Pengenalan AscISitus Pengenalan AvaISitus Pengenalan BamHISitus Pengenalan BclISitus Pengenalan BglIISitus Pengenalan BsiWISitus Pengenalan BspHISitus Pengenalan BsrGISitus Pengenalan BssHIISitus Pengenalan BstBISitus Pengenalan ClaISitus Pengenalan DraISitus Pengenalan EagISitus Pengenalan EcoRISitus Pengenalan EcoRVSitus Pengenalan FseISitus Pengenalan HaeIIISitus Pengenalan HhaISitus Pengenalan HincIISitus Pengenalan HindIIISitus Pengenalan HinfISitus Pengenalan HpaISitus Pengenalan KpnISitus Pengenalan MfeISitus Pengenalan MluISitus Pengenalan MseISitus Pengenalan MspISitus Pengenalan NaeISitus Pengenalan NcoISitus Pengenalan NdeISitus Pengenalan NheISitus Pengenalan NotISitus Pengenalan NruISitus Pengenalan NsiISitus Pengenalan PacISitus Pengenalan PmeISitus Pengenalan PstISitus Pengenalan PvuISitus Pengenalan PvuIISitus Pengenalan RsaISitus Pengenalan SacISitus Pengenalan SacIISitus Pengenalan SalISitus Pengenalan Sau3AISitus Pengenalan ScaISitus Pengenalan SfiISitus Pengenalan SmaISitus Pengenalan SnaBISitus Pengenalan SpeISitus Pengenalan SphISitus Pengenalan SspISitus Pengenalan StuISitus Pengenalan SwaISitus Pengenalan TaqISitus Pengenalan XbaISitus Pengenalan XhoISitus Pengenalan XmaI
Alat sekuens DNA dan protein lainnya
Komplemen BalikDNA ke RNAGabungkan Sekuens FASTAPecah Sekuens FASTAGenBank ke FASTAEMBL ke FASTAEkstraktor Fitur GenBankEkstraktor Fitur EMBLEkstraktor Translasi GenBankEkstraktor Translasi EMBLPecah Menjadi KodonEkstraktor Rentang DNAEkstraktor Rentang ProteinEkstraktor Jendela DNAEkstraktor Jendela ProteinBersihkan DNABersihkan ProteinKelompokkan DNAKelompokkan ProteinAsam Amino Satu ke Tiga HurufAsam Amino Tiga ke Satu HurufStatistik DNAStatistik ProteinPenggunaan KodonPencari Pulau CpGBerat Molekul DNABerat Molekul ProteinTitik Isoelektrik ProteinGRAVY ProteinCari Pola DNACari Pola ProteinPencarian Mirip DNAPencarian Mirip ProteinIdentitas dan KemiripanPencari ORFTranslasi DNA ke ProteinTranslasi BalikTranslasi Balik Penyejajaran ProteinStatistik Primer PCRProduk PCRRingkasan RestriksiMutasi untuk DigestiSejajarkan Dua DNASejajarkan Dua ProteinSejajarkan KodonOptimasi KodonPencari Pemandu CRISPRPeta TranslasiPeta PrimerWarnai Penyejajaran Menurut KonservasiWarnai Penyejajaran Menurut SifatPlot KodonPenampil Peta PlasmidSekuens DNA AcakSekuens Protein AcakDNA Penyandi AcakWilayah DNA AcakWilayah Protein AcakSampel DNASampel ProteinAcak Urutan DNAAcak Urutan ProteinMutasikan DNAMutasikan ProteinKode GenetikKode IUPAC