Toolyard

Situs Pengenalan BglII


Ringkasan BglII

5' A|GATCT 3'
3' TCTAG|A 5'
Situs pengenalan5'-AGATCT-3'
PotonganA^GATCT
Ujungujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (GATC)
Frekuensi perkiraansekitar sekali setiap 4.096 bp pada DNA acak
Ujung yang kompatibelBamHI, BclI, Sau3AI

Cara menemukan situs BglII dalam sekuens

  1. Tempel sekuens DNA atau rekaman FASTA di kotak di atas. BglII sudah terisi di Hanya enzim ini.
  2. Centang DNA sirkular untuk plasmid, agar situs yang melintasi ujung dan awal sekuens juga ditemukan.
  3. Peta menandai setiap potongan BglII beserta posisinya. Salin atau unduh hasil di bawahnya.

Pertanyaan umum

Sekuens apa yang dipotong BglII?

BglII mengenali AGATCT (ditulis dari 5' ke 3') dan memotong untai atas di A^GATCT.

Apakah BglII menghasilkan ujung lengket atau tumpul?

Ujung lengket: ujung 5' menggantung sepanjang 4 basa (GATC).

Enzim apa yang menghasilkan ujung yang kompatibel dengan BglII?

BamHI, BclI, dan Sau3AI. Bagian menggantungnya sama, jadi ujung-ujungnya bisa diligasi satu sama lain.

Seberapa sering BglII memotong?

Situs seperti AGATCT muncul sekitar sekali setiap 4.096 bp pada DNA acak. Sekuens nyata bervariasi, jadi periksa sekuens Anda di atas.

Enzim restriksi

Alat sekuens DNA dan protein lainnya

Panduan