Sitio de reconocimiento de PacI
PacI de un vistazo
5' TTAAT|TAA 3' 3' AAT|TAATT 5'
| Sitio de reconocimiento | 5'-TTAATTAA-3' |
| Corte | TTAAT^TAA |
| Extremos | un extremo 3' protuberante de 2 bases (AT) |
| Frecuencia esperada | aproximadamente una vez cada 65.536 pb en ADN aleatorio |
| Extremos compatibles | PvuI |
Cómo encontrar sitios de PacI en una secuencia
- Pega una secuencia de ADN o un registro FASTA en el cuadro de arriba. PacI ya está escrita en Solo estas enzimas.
- Marca ADN circular si es un plásmido, para encontrar también un sitio que cruce el final y el principio.
- El mapa marca cada corte de PacI con su posición. Copia o descarga el resultado que aparece debajo.
Preguntas frecuentes
¿Qué secuencia corta PacI?
PacI reconoce TTAATTAA (escrita de 5' a 3') y corta la hebra superior en TTAAT^TAA.
¿PacI deja extremos cohesivos o romos?
Extremos cohesivos: un extremo 3' protuberante de 2 bases (AT).
¿Qué enzimas dejan extremos compatibles con PacI?
PvuI. Sus protuberancias son iguales, así que los extremos se pueden ligar entre sí.
¿Con qué frecuencia corta PacI?
Un sitio como TTAATTAA aparece aproximadamente una vez cada 65.536 pb en ADN aleatorio. Las secuencias reales varían, así que comprueba la tuya arriba.
Enzimas de restricción
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