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プライマーとオリゴの溶かし方

計算式

オリゴは乾燥状態で届き、量はチューブかデータシートにnmolで書かれています。µMのストックを作るには:

加える量 (µL) = nmol × 1,000 ÷ 濃度 (µM)

一般的な100 µMストックなら、単にnmol × 10です。25.4 nmolのチューブなら254 µLです。µgで書かれている場合は、nmol = µg × 1,000 ÷ 分子量です。

手順

  1. ふたを閉めたままチューブを軽く遠心し、乾燥したペレットをふたではなく底に集めます。
  2. 計算した量の低EDTA TE(10 mM Tris、0.1 mM EDTA、pH 8)またはヌクレアーゼフリー水を加えます。
  3. ボルテックスし、室温で数分置いてから再びボルテックスし、スピンダウンします。

使用液を作る

PCRでは通常10 µMのプライマーを使います。100 µMストックからは10倍希釈で、ストック10 µLに水かTE 90 µLを加えると10 µMが100 µLできます。使用液のチューブを分けておけば、ストックを何度もピペットで触らずに済みます。

水とTEのどちらか

TEはpHを一定に保ち、やや酸性の水はDNAを少しずつ傷めることがあるので、TEのストックのほうが長持ちします。低EDTA TEに含まれるわずかなEDTAは、使用濃度ではPCRに影響するほどマグネシウムと結合しません。ただし、一部のシーケンス反応など、水を指定する用途もあります。

保存

ストックは−20 °Cで保存します。いくつかに分注しておけば、1本が汚染されたり凍結融解を繰り返したりしても注文分すべてを失わずに済みます。乾燥したオリゴは何年も、TEのストックは凍結で何か月も保存できます。

計算ツール

オリゴ溶解の計算は、任意のストック濃度に必要な量と使用液の混ぜ方を示します。プライマーの分子量はPCRプライマーの統計で、そのほかの希釈は希釈計算で求められます。

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