এনজাইম ও প্রোটিন: পাঠ নির্দেশিকা

মূল ধারণা

উৎসেচক সক্রিয়ণ শক্তি কমিয়ে বিক্রিয়াকে দ্রুত করে, এবং মাইকেলিস–মেন্টেন সমীকরণ বলে হার কীভাবে সাবস্ট্রেটের ঘনমাত্রার উপর নির্ভর করে। নিরোধক ছবিটিকে অনুমানযোগ্যভাবে বদলায়।

• মাইকেলিস–মেন্টেন: v = Vmax[S] ÷ (Km + [S])। [S] = Km হলে হার ঠিক Vmax-এর অর্ধেক, তাই Km মাপে সাবস্ট্রেট কত দৃঢ়ভাবে যুক্ত হয় (কম Km, দৃঢ় বন্ধন)।
• খুব বেশি [S]-এ উৎসেচক সম্পৃক্ত হয় এবং v, Vmax-এর কাছে পৌঁছায়। টার্নওভার সংখ্যা kcat = Vmax ÷ [E], অর্থাৎ একটি উৎসেচক প্রতি সেকেন্ডে কতটি সাবস্ট্রেট অণু রূপান্তর করে।
• প্রতিযোগিতামূলক নিরোধক সাবস্ট্রেটের সাথে প্রতিযোগিতা করে: Vmax অপরিবর্তিত থাকে এবং Km বড় দেখায়। অপ্রতিযোগিতামূলক নিরোধক Vmax কমায় এবং Km অপরিবর্তিত রাখে।
• তাপমাত্রা ও pH হার বদলায়, এবং চরম মান উৎসেচককে বিকৃত করে। প্রোটিনের ঘনমাত্রা 280 nm-এ তার শোষণাঙ্ক দিয়ে মাপা যায়।

মূল সমীকরণ

• v = Vmax[S] ÷ (Km + [S])
• kcat = Vmax ÷ [E]
• A = εcl
• at [S] = Km, v = Vmax ÷ 2

সমাধান করা উদাহরণ

একটি উৎসেচকের Vmax = 100 µmol/min ও Km = 2 mM। [S] = 6 mM-এ v = 100 × 6 ÷ (2 + 6) = 75 µmol/min, এবং [S] = 2 mM-এ 50 µmol/min। 0.010 µmol উৎসেচক সেই Vmax দিলে kcat = 100 ÷ 0.010 = 10 000 min⁻¹, অর্থাৎ প্রায় 167 s⁻¹।

সাধারণ ভুল

• ভাবা যে Km হল সেই সাবস্ট্রেট ঘনমাত্রা যা Vmax দেয়। এটি Vmax-এর অর্ধেক দেয়।
• বলা যে প্রতিযোগিতামূলক নিরোধক Vmax কমায়। বেশি সাবস্ট্রেট দিয়ে এটি অতিক্রম করা যায়, তাই Vmax বদলায় না।
• স্থির হয়ে যাওয়া হারকে উৎসেচক নষ্ট হওয়ার চিহ্ন ধরা। এটি সম্পৃক্ত, বিকৃত নয়।

অনুশীলন

এই বিষয়ের অনুশীলন প্রশ্ন দিয়ে নিজেকে যাচাই করুন: এনজাইম ও প্রোটিন