প্রোটিনের ঘনমাত্রার হিসাব (A280)
A280 থেকে প্রোটিনের ঘনমাত্রা কীভাবে হিসাব করবেন
- A280 পাঠ, লঘুকরণের গুণক আর পথের দৈর্ঘ্য লিখুন।
- শোষণ গুণাঙ্কটি কোথা থেকে আসবে তা বেছে নিন: প্রোটিনের সিকোয়েন্স সেঁটে দিন, মোলার গুণাঙ্ক ও আণবিক ভর লিখুন, না Abs 0.1% লিখুন।
- ঘনমাত্রাটি mg/mL-এ চলে আসে, আর আণবিক ভর জানা থাকলে µM-এও।
সাধারণ প্রশ্ন
সিকোয়েন্স থেকে শোষণ গুণাঙ্ক কীভাবে বের হয়?
Pace ও সহকর্মীদের (1995) উপায়ে: প্রতিটি ট্রিপ্টোফ্যানের জন্য 5,500 M⁻¹ cm⁻¹, প্রতিটি টাইরোসিনের জন্য 1,490 আর প্রতিটি সিস্টিনের (ডাইসালফাইড বন্ধনে এক জোড়া সিস্টিন) জন্য 125। সিস্টিনগুলো মুক্ত থাকলে “বিজারিত” বেছে নিন।
Abs 0.1% কী?
1 সেমি ঘরে 1 mg/mL দ্রবণের 280 nm-এ শোষণ, যা শোষণ গুণাঙ্ক ভাগ আণবিক ভর। mg/mL-এ ঘনমাত্রা = A280 ÷ Abs 0.1%।
এটি আমার প্রোটিনে চলছে না কেন?
যে প্রোটিনে ট্রিপ্টোফ্যান বা টাইরোসিন নেই, তা 280 nm-এ প্রায় কিছুই শোষণ করে না। ব্র্যাডফোর্ড বা BCA-র মতো একটি রং-নির্ভর পরীক্ষা ব্যবহার করুন, কিংবা 205 nm-এ মাপুন।
আরও জীববিজ্ঞান ল্যাবের ক্যালকুলেটর
DNA-র ঘনমাত্রার হিসাবDNA-র অনুলিপি সংখ্যার হিসাবলাইগেশনের হিসাবRCF থেকে RPM রূপান্তরকারীকোষের দ্বিগুণ হওয়ার সময়ের হিসাবহিমোসাইটোমিটারের হিসাবহার্ডি-ভাইনবার্গের হিসাবপানেট স্কোয়ারের হিসাবপ্রাইমারের Tm-র হিসাবΔΔCt-র হিসাবপ্রোটিনের শোষণ গুণাঙ্কের হিসাবঅলিগো গুলিয়ে নেওয়ার হিসাবMOI-র হিসাবকোষ বসানোর হিসাবট্রান্সফরমেশনের দক্ষতার হিসাবOD600-র হিসাবআদর্শ বাঁকের হিসাবIC50-র হিসাবPCR মাস্টার মিক্সের হিসাবঅ্যাগারোজ জেলের হিসাবSDS-PAGE জেলের হিসাবস্টক দ্রবণের হিসাবআবার গুলিয়ে নেওয়ার হিসাবজেলের ব্যান্ডের মাপের আন্দাজ