জেলের ব্যান্ডের মাপের আন্দাজ
একটি জেল থেকে ব্যান্ডের মাপের আন্দাজ কীভাবে নেবেন
- ল্যাডারের প্রতিটি ব্যান্ড কুয়ো থেকে কতদূর দৌড়াল তা মাপুন, ছাপা কাগজে মিলিমিটারে বা ছবিতে পিক্সেলে, আর মাপগুলো তাদের দূরত্বসহ লিখুন।
- আপনার নিজের ব্যান্ডগুলোও একইভাবে মেপে তাদের দূরত্ব লিখুন।
- প্রতিটি ব্যান্ডের মাপ বসানো বাঁক থেকে পড়ে নেওয়া হয়, সঙ্গে ফিটের R²।
সাধারণ প্রশ্ন
ফিটটি কীভাবে কাজ করে?
DNA এমন হারে চলে, যা তার দৈর্ঘ্যের লগারিদমের সঙ্গে কমে, তাই দূরত্বের বিপরীতে log10(মাপ)-এর একটি সরলরেখা একটি জেলের বেশির ভাগই ভালো বর্ণনা করে। বাঁকানো ফিটটি একটি বর্গ-পদ জুড়ে দেয়, যা জেলের একেবারে ওপরে আর তলার মোচড়গুলো মেনে চলে।
কোথা থেকে মাপব?
প্রতিটি ব্যান্ডের একই বিন্দু থেকে, সাধারণত সামনের ধার, কুয়োর তলা থেকে মাপা। একটি ব্যান্ডের সামনের দিক আর আরেকটির মাঝখান মিলিয়ে ফেলাই সবচেয়ে বড় ভুলের উৎস।
পিক্সেলে মাপতে পারি?
হ্যাঁ। ফিটের কেবল এটাই দরকার যে ল্যাডার আর আপনার ব্যান্ড একই এককে মাপা হয়েছে, তাই জেলের ছবির পিক্সেলও ছাপা কাগজের মিলিমিটারের মতোই চলে। ছবিটি যেন সোজা হয়ে তোলা হয়, হেলে নয়, তা দেখে নিন।
এটি কতটা নিখুঁত?
ল্যাডারের পরিসরের ভেতরে সাধারণত 5% থেকে 10%-এর মধ্যে। তার বাইরে ফিটটি বাইরে টেনে বের করছে আর অনেকটা ভুল হতে পারে, সেই কারণেই সবচেয়ে ছোট ল্যাডারের ব্যান্ড ছাড়িয়ে যাওয়া ব্যান্ড চিহ্নিত করা হয়।
আমার R² কম কেন?
হয় কোনো দূরত্ব ভুল লেখা হয়েছে, জেলটি অসমানভাবে দৌড়েছে বা হেসে গেছে, নইলে ল্যাডারের মাপগুলো আপনি আসলে যে ল্যাডার দিয়েছিলেন তার সঙ্গে মেলে না। আগে চরম দুই দিক দেখুন; সেগুলোই ফিটকে সবচেয়ে জোরে টানে।
কোন ল্যাডারের মাপগুলো লিখব?
নলে যা লেখা আছে। আগে থেকে বসানো আছে চেনা একটি 1 kb ল্যাডার, তবে সরবরাহকারীতে সরবরাহকারীতে ল্যাডার আলাদা, তাই আপনার নিজের পণ্যের পাতা থেকে মাপগুলো নকল করে নিন।