젤 띠 크기 추정
젤에서 띠 크기를 추정하는 방법
- 표지의 각 띠가 우물에서 얼마나 내려갔는지 재십시오. 인쇄물이면 밀리미터, 사진이면 화소로 재고, 길이와 거리를 함께 적습니다.
- 내 띠도 같은 방식으로 재고 거리를 적습니다.
- 각 띠의 길이가 맞춘 곡선에서 읽히고, 맞춤의 R²도 함께 나옵니다.
자주 묻는 질문
맞춤은 어떻게 작동합니까?
DNA는 길이의 로그에 따라 느려지는 속도로 움직이므로, log10(길이)을 거리에 대해 그린 직선이 젤의 대부분을 잘 설명합니다. 곡선 맞춤은 2차 항을 더해 젤의 위아래 끝에서 휘는 모양을 따라갑니다.
어디서부터 재야 합니까?
모든 띠에서 같은 지점, 보통 앞쪽 가장자리를 우물 아래쪽부터 잽니다. 어떤 띠는 앞쪽, 다른 띠는 가운데를 재는 것이 가장 큰 오차의 원인입니다.
화소로 재도 됩니까?
됩니다. 맞춤에 필요한 것은 표지와 내 띠를 같은 단위로 쟀다는 것뿐이라, 젤 사진의 화소도 인쇄물의 밀리미터만큼 쓸 만합니다. 사진은 비스듬히가 아니라 정면에서 찍으십시오.
얼마나 정확합니까?
표지 범위 안에서는 보통 5~10%입니다. 범위를 벗어나면 외삽이라 크게 틀릴 수 있어서, 가장 작은 표지 띠보다 더 내려간 띠에는 표시가 붙습니다.
R²가 왜 낮습니까?
거리를 잘못 입력했거나, 젤이 비뚤게 흘렀거나 미소를 지었거나, 표지 길이가 실제로 올린 표지와 다른 경우입니다. 양쪽 끝을 먼저 보십시오. 맞춤을 가장 세게 당깁니다.
어떤 표지 길이를 넣어야 합니까?
튜브에 적힌 값입니다. 기본값은 흔한 1 kb 표지이지만 표지는 공급사마다 다르니, 자기 제품 설명서에서 옮겨 적으십시오.