Jel bant boyutu tahmincisi

Bir jelden bant boyutu nasıl tahmin edilir

1. Her merdiven bandının kuyucuktan ne kadar yürüdüğünü bir çıktıda milimetre ya da bir fotoğrafta piksel olarak ölç ve boyutları uzaklıklarıyla yaz.
2. Kendi bantlarını da aynı şekilde ölç ve uzaklıklarını yaz.
3. Her bandın boyutu uydurulan eğriden, uydurmanın R² değeriyle birlikte okunur.

Sık sorulan sorular

Uydurma nasıl çalışıyor?

DNA uzunluğunun logaritmasıyla azalan bir hızla hareket eder; bu yüzden uzaklığa karşı log10(boyut) üzerinden geçen bir doğru bir jelin büyük kısmını iyi tanımlar. Eğri uydurma, jelin en üstündeki ve en altındaki bükülmeleri izleyen bir kare terimi ekler.

Nereden ölçerim?

Her bantta aynı noktadan, genellikle ön kenardan, kuyucuğun dibinden ölçerek. Bir bandın önünü başka bir bandın ortasıyla karıştırmak en büyük hata kaynağıdır.

Piksel olarak ölçebilir miyim?

Evet. Uydurma yalnızca merdivenin ve bantlarının aynı birimde ölçülmesini ister; bu yüzden bir jel fotoğrafındaki pikseller bir çıktıdaki milimetreler kadar iyi çalışır. Fotoğrafın açılı değil karşıdan çekildiğinden emin ol.

Ne kadar doğru?

Merdivenin aralığı içinde genellikle %5–10 içinde. Bunun dışında uydurma dışa değerlendirme yapar ve çok sapabilir; en küçük merdiven bandının ötesine yürüyen bir bandın işaretlenmesinin nedeni budur.

R²’m neden düşük?

Ya bir uzaklık yanlış yazıldı, ya jel düzensiz yürüdü ya da gülümsedi ya da merdiven boyutları gerçekten yüklediğin merdivenle eşleşmiyor. Önce uç değerleri kontrol et; uydurmayı en çok onlar çeker.

Hangi merdiven boyutlarını girmeliyim?

Tüpte ne yazıyorsa. Varsayılan tipik bir 1 kb merdivendir, ama merdivenler tedarikçiden tedarikçiye değişir; bu yüzden boyutları kendi ürün sayfandan kopyala.