Toolyard

Ферменты и белки: учебное руководство

Главные идеи

Ферменты ускоряют реакции, снижая энергию активации, а уравнение Михаэлиса — Ментен описывает, как скорость зависит от концентрации субстрата. Ингибиторы меняют картину предсказуемым образом.

  • Михаэлис — Ментен: v = Vmax[S] ÷ (Km + [S]). При [S] = Km скорость ровно вдвое меньше Vmax, поэтому Km показывает, насколько прочно связывается субстрат (меньше Km — прочнее связь).
  • При очень высоком [S] фермент насыщен, и v приближается к Vmax. Число оборотов kcat = Vmax ÷ [E] — это число молекул субстрата, превращаемых одним ферментом за секунду.
  • Конкурентный ингибитор соперничает с субстратом: Vmax не меняется, а Km кажется больше. Неконкурентный ингибитор снижает Vmax и не меняет Km.
  • Температура и pH меняют скорости, а крайние значения денатурируют фермент. Концентрацию белка можно измерить по поглощению при 280 нм.

Основные формулы

  • v = Vmax[S] ÷ (Km + [S])
  • kcat = Vmax ÷ [E]
  • A = εcl
  • at [S] = Km, v = Vmax ÷ 2

Разобранный пример

У фермента Vmax = 100 мкмоль/мин и Km = 2 мМ. При [S] = 6 мМ v = 100 × 6 ÷ (2 + 6) = 75 мкмоль/мин, а при [S] = 2 мМ — 50 мкмоль/мин. Если 0,010 мкмоль фермента дали такую Vmax, то kcat = 100 ÷ 0,010 = 10 000 мин⁻¹, то есть около 167 с⁻¹.

Частые ошибки

  • Мнение, что Km — это концентрация субстрата, дающая Vmax. Она даёт половину Vmax.
  • Утверждение, что конкурентный ингибитор снижает Vmax. Его преодолевают избытком субстрата, поэтому Vmax не меняется.
  • Принятие выровнявшейся скорости за признак разрушения фермента. Он насыщен, а не денатурирован.

Практика

Проверьте себя на тренировочных вопросах по этой теме: Ферменты и белки

Инструменты из этого руководства

Другие руководства

Закон Снеллиуса, преломление и полное внутреннее отражениеАтомные орбитали: s, p, d и fКак работает гель-электрофорез и как читать гель с ДНКФазы Луны, приливы и затменияБиномиальное распределение, колоколообразная кривая и доска ГальтонаПоследовательные и параллельные цепиКак работают буферы: уравнение Хендерсона — Хассельбаха и буферная ёмкостьМитоз и мейоз: фазы, кроссинговер и нерасхождениеКак работает парниковый эффектРяды Фурье: как собрать волну из синусоидЗакон Бернулли: неразрывность, расходомеры Вентури и трение в трубахКак работает электромагнитная индукция: закон Фарадея, правило Ленца, генераторы и трансформаторыКак работает хроматография: Rf, колонки и разрешениеЗакон Бугера — Ламберта — Бера: оптическая плотность, спектрофотометры и калибровочные кривыеКак идёт синтез белка: транскрипция, трансляция и мутацииФотосинтез и лимитирующие факторы: свет, углекислый газ и температураЦиклы хищников и жертв: уравнения Лотки — ВольтеррыЭпидемические модели SIR и SEIR: R₀, коллективный иммунитет и сглаживание кривойЖизненный цикл звезды и диаграмма Герцшпрунга — РасселаКристаллические решётки, элементарные ячейки и рентгеновская дифракцияСтроение клетки и органоиды: учебное руководствоМембраны и транспорт: учебное руководствоКлетки и транспорт: учебное руководствоДыхание и фотосинтез: учебное руководствоКлеточный цикл и мейоз: учебное руководствоЭкспрессия генов и синтез белка: учебное руководствоЭволюция и естественный отбор: учебное руководствоЭкология и поток энергии: учебное руководствоФизиология человека: учебное руководствоНервы и мышцы: учебное руководствоБиология растений: учебное руководствоИммунитет и эпидемиология: учебное руководствоБиотехнология и молекулярные методы: учебное руководствоРост и подсчёт микроорганизмов: учебное руководствоСтроение атома и свет: учебное руководствоКинетика реакций: учебное руководствоХимическое равновесие: учебное руководствоСвободная энергия и самопроизвольность: учебное руководствоВероятность и распределения: учебное руководствоОрбиты и свет звёзд: учебное руководствоЗемлетрясения, плиты и датирование: учебное руководствоНоменклатура (названия соединений): учебное руководствоФункциональные группы: учебное руководствоСтроение и связи: учебное руководствоУглеводороды: алканы, алкены и алкины: учебное руководствоСпирты, фенолы и простые эфиры: учебное руководствоАльдегиды и кетоны: учебное руководствоКарбоновые кислоты и их производные: учебное руководствоАмины: учебное руководствоАроматические соединения: учебное руководствоСтереохимия: учебное руководствоЗамещение, отщепление и карбокатионы: учебное руководствоФизические свойства и кислотность: учебное руководствоЯМР- и ИК-спектроскопия: учебное руководствоЛабораторные методы: учебное руководствоКинематика: учебное руководствоЭлектромагнитная индукция: учебное руководствоСовременная физика: учебное руководствоДвижение брошенного тела: учебное руководствоРабота, энергия и мощность: учебное руководствоИмпульс и столкновения: учебное руководствоДвижение по окружности и гравитация: учебное руководствоКолебания: учебное руководствоЖидкости и газы: учебное руководствоВолны и звук: учебное руководствоОптика: учебное руководствоЭлектростатика: учебное руководствоМагнетизм: учебное руководство