아가로스 겔 만드는 방법

농도 고르기

농도에 따라 겔이 가장 잘 분리하는 DNA 크기가 정해집니다. 낮은 농도는 구멍이 커서 큰 조각에, 높은 농도는 작은 조각에 알맞습니다.

0.7%: 약 0.8~12 kb
1%: 약 0.5~10 kb, PCR 산물과 플라스미드에 흔히 씀
1.5%: 약 0.2~3 kb
2%: 약 50 bp~2 kb

양 계산

겔 농도는 버퍼 100 mL당 아가로스 그램이므로 그램 = % × 부피(mL) ÷ 100입니다. 50 mL, 1% 겔에는 0.5 g이 필요합니다. 버퍼는 스톡에서 1×로 만듭니다. 50 mL당 50× TAE 1 mL, 또는 10× TBE 5 mL입니다. 전기영동 탱크에도 같은 버퍼를 씁니다.

겔 붓기

아가로스를 플라스크에 달아 넣고 1× 버퍼를 붓습니다.
전자레인지에서 짧게 나눠 가열하며 사이사이 돌려 섞고, 떠다니는 알갱이 없이 완전히 투명해질 때까지 녹입니다. 갑자기 끓어 넘칠 수 있으니 지켜보세요.
플라스크를 잡을 수 있는 약 50~60 °C까지 식힙니다.
겔 안에서 염색한다면 DNA 염색약을 넣고 돌려 섞은 뒤, 코움을 꽂은 트레이에 붓습니다.
20~30분 굳힌 뒤 코움을 조심스럽게 뺍니다.

영동하기

DNA는 양극(빨강) 쪽으로 이동하므로 웰이 음극(검정) 쪽에 오게 겔을 탱크에 놓고 버퍼로 덮습니다. 로딩 다이와 섞은 시료를 DNA 래더와 나란히 넣고, 전극 사이 1 cm당 약 5~8 V로 다이 선두가 3분의 2쯤 내려갈 때까지 영동합니다.

계산기

아가로스 겔 계산기는 어떤 농도와 부피든 아가로스, 버퍼, 물, 염색약 양을 알려 줍니다. 정해진 양의 DNA를 넣으려면 먼저 DNA 농도 계산기로 재세요.

이 가이드에서 쓰는 도구

아가로스 겔 계산기 DNA 농도 계산기

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