Kromatografi simülatörü
Bu benzetimdeki denklemler
| R_f | bir plakadaki alıkonma faktörü | 0 (başlangıç çizgisinde kalır) ile 1 (cepheyle birlikte gider) arası; iki uzaklık da başlangıç çizgisinden ölçülür | |
|---|---|---|---|
| d_cephe | çözücünün aldığı yol | çözücü plakayı ıslattıkça zamanın kareköküyle artar |
Mevcut değerlerle:
| k | alıkonma faktörü: plakaya ya da dolguya yapışık süre ÷ çözücüdeki süre | bileşik çözücüye göre ne kadar polarsa k o kadar büyük | |
|---|---|---|---|
| p | bileşiğin polaritesi | kabaca 0’dan 1’e uzanan bir ölçekte (çok apolar bileşikler 0’ın altına düşer), Rf değerleri bir referans çözücüde yayımlanmış değerlerle eşleşecek şekilde ayarlanmış | |
| s | çözücünün polaritesi | Çözücü menüsünden ayarlanır; daha polar bir çözücü polar bileşikleri daha ileri taşır |
Mevcut değerlerle:
| t_R | kolondaki bir tepenin alıkonma süresi | t₀, çözücünün kendisinin geçme süresidir; Akış hızı (dakikada mL, kolon) ile ayarlanır | |
|---|---|---|---|
| N | Kolon verimi N (kuramsal tabaka) | daha iyi doldurulmuş ya da daha uzun bir kolon daha dar tepeler verir |
Mevcut değerlerle:
| R_s | en yakın iki leke ya da tepenin ayrımı | yaklaşık 1,5 ya da üzeri temiz bir ayrımdır; 1’in altında örtüşürler |
|---|
Mevcut değerlerle:
Kromatografi simülatörü nasıl kullanılır
- Bir plaka, bir karışım ve bir çözücü seç. Çözücü plakayı alttan emer, cephe mavi bir çizgiyle işaretlenir; her bileşik, polar plakaya ne kadar güçlü yapıştığına ve çözücünün onu ne kadar iyi taşıdığına bağlı olarak cephenin aldığı yolun sabit bir kesrini ilerler. Cephe tepeye ulaşınca plaka çıkarılır; sonuçlar her lekenin uzaklığını ve Rf değerini listeler.
- Yaprak pigmentlerini önce hekzan ve asetonla, sonra saf hekzanla ya da etil asetatla dene ve ayrılmanın değiştiğini izle; amino asitler ninhidrin boyasını işaretleyene kadar renksizdir. Grafik, kuyu boyunca yukarı doğru renk yoğunluğunun bir taramasıdır; ayırma gücü de en yakın iki lekenin örtüşüp örtüşmediğini söyler. Lekeler çözücüye daldırılınca ne olduğunu görmek için «Çözücü başlangıç çizgisinin üzerinde (yaygın bir hata)»yı işaretle.
- Kolona geç: bantlar farklı hızlarla aşağı iner ve tepelerden oluşan bir kromatogram çizen bir dedektöre çıkar. Daha dar tepeler için verim N’yi artır, ölü zaman t₀’ı değiştirmek için akış hızını değiştir ve alıkonma sürelerini ve ayırma gücünü karşılaştır. Jel elektroforezi simülatörü ise DNA’yı boyuta göre ayırır.
Sık sorulan sorular
Rf değeri nedir?
Bir plakadaki alıkonma faktörü: bir lekenin aldığı yolun çözücü cephesinin aldığı yola bölümü; ikisi de örneğin konduğu başlangıç çizgisinden ölçülür. 0 (bileşik hareket etmez) ile 1 (çözücüyle birlikte hareket eder) arasındadır. Belirli bir plaka, çözücü ve sıcaklıkta bir bileşiğin Rf’si hep yaklaşık aynıdır; lekeler böyle tanımlanır.
Bileşikler neden ayrılıyor?
Her bileşik zamanının bir kısmını durgun faza (kâğıt, İTK plakasının silikası ya da bir kolonun dolgusu) yapışık, bir kısmını hareketli çözücüde çözünmüş geçirir. Oran onun alıkonma katsayısı k’dir ve Rf = 1 ÷ (1 + k). Daha çok yapışan bileşikler daha yavaş hareket eder. Polar bir plakada polar bileşikler en çok yapışır; bu yüzden daha polar bir çözücü onları daha uzağa taşır.
Başlangıç çizgisi neden çözücünün üstünde olmalı?
Lekeler tanktaki çözücünün yüzeyinin altında kalırsa plakada yukarı taşınmak yerine doğrudan çözücüde çözünürler. Başlangıç çizgisini alttan yaklaşık 1 cm yukarıya kurşun kalemle çiz (mürekkep kendisi ayrılırdı) ve çözücü onun altında kalsın.
Kromatografide ayırma gücü ne anlama geliyor?
Komşu iki tepenin ya da lekenin ne kadar iyi ayrıldığı: Rs = 2 × alıkonma süresi farkı ÷ tepe genişlikleri toplamı. Rs = 1’de yaklaşık %2 örtüşürler; 1,5’te taban çizgisine kadar ayrılmışlardır. Daha dar tepeler (daha yüksek verim N) ya da k’de daha büyük bir fark onu iyileştirir.
WebGL’nin kapalı olduğunu söylüyor.
3B görünüm, güncel her tarayıcıda bulunan WebGL’ye ihtiyaç duyar. Tarayıcı ayarlarında donanım hızlandırma kapatılmışsa ya da grafik sürücüsü çok eskiyse kapalı olabilir. Donanım hızlandırmayı aç ya da başka bir tarayıcı dene.
Bir şey yükleniyor mu?
Hayır. Simülasyonu WebGL ile kendi tarayıcın çizer; hiçbir yere hiçbir şey gönderilmez ve sayfa yüklendikten sonra çevrimdışı da çalışmaya devam eder.