प्रोटीन संश्लेषण सिम्युलेटर: अनुलेखन और अनुवाद

प्रोटीन संश्लेषण सिम्युलेटर का उपयोग कैसे करें

1. एक जीन चुनें या अपना DNA टाइप करें (कोडिंग रज्जुक, 5′ से 3′)। RNA पॉलिमरेज़ द्वि-कुंडली खोलता है और उसके साथ संदेशवाहक RNA बनाता है, जिसका अनुक्रम कोडिंग रज्जुक जैसा होता है पर T की जगह U। फिर राइबोसोम पहला AUG ढूँढता है और mRNA को एक बार में तीन क्षार पढ़ता है; हर स्थानांतरण RNA अपने कोडॉन का अमीनो अम्ल लाता है, और शृंखला स्टॉप कोडॉन तक बढ़ती है।
2. परिणाम mRNA, आरंभ कोडॉन से कोडॉन, एक और तीन अक्षरों के कोड में प्रोटीन और उसका द्रव्यमान दिखाते हैं। उत्परिवर्तन करें: प्रतिस्थापन, सम्मिलन या विलोपन, उसकी स्थिति और नया क्षार चुनें। सिमुलेशन दोनों प्रोटीनों की तुलना करके असर का नाम बताता है: मौन, मिसेंस, नॉनसेंस, फ़्रेमशिफ़्ट, आरंभ कोडॉन खो गया या स्टॉप कोडॉन खो गया। β-ग्लोबिन के क्षार 20 पर T से प्रतिस्थापन सिकल सेल रोग का उत्परिवर्तन है।
3. ग्राफ़ मूल और उत्परिवर्तित प्रोटीन की हाइड्रोपैथी अवशेष दर अवशेष दिखाता है; फ़्रेमशिफ़्ट उत्परिवर्तन के बाद सब कुछ उलट-पुलट कर देता है। चुनें कि कौन सा जीन एनिमेट हो, मूल या उत्परिवर्तित, और गति भी। DNA को प्रोटीन में ट्रांसलेट करें और ORF खोजक टूल लंबे अनुक्रमों को सभी छह रीडिंग फ़्रेम में संभालते हैं।

अक्सर पूछे जाने वाले सवाल

अनुलेखन और अनुवाद क्या हैं?

अनुलेखन किसी जीन के DNA को संदेशवाहक RNA में कॉपी करता है, जिसे RNA पॉलिमरेज़ टेम्पलेट रज्जुक पढ़कर बनाता है। अनुवाद mRNA को प्रोटीन में बदलता है: राइबोसोम उसे कोडॉन दर कोडॉन, एक बार में तीन क्षार पढ़ता है, और स्थानांतरण RNA मेल खाते अमीनो अम्ल लाते हैं। जीवाणुओं में दोनों एक साथ कोशिकाद्रव्य में होते हैं; यूकैरियोट में mRNA पहले केंद्रक में बनता और संसाधित होता है।

कितने कोडॉन होते हैं?

चार क्षार तीन-तीन करके लेने पर 4³ = 64 कोडॉन बनते हैं। इकसठ कोडॉन 20 अमीनो अम्लों को कोड करते हैं, इसलिए ज़्यादातर अमीनो अम्लों के कई कोडॉन हैं, और तीन (UAA, UAG, UGA) स्टॉप कोडॉन हैं। AUG मेथियोनीन को कोड करता है और यह भी बताता है कि अनुवाद कहाँ से शुरू हो।

मिसेंस, नॉनसेंस और फ़्रेमशिफ़्ट उत्परिवर्तन में क्या अंतर है?

मिसेंस उत्परिवर्तन एक कोडॉन को किसी दूसरे अमीनो अम्ल के कोडॉन में बदलता है, जैसे सिकल सेल रोग में GAG बदलकर GTG हो जाता है और ग्लूटामेट वैलीन बन जाता है। नॉनसेंस उत्परिवर्तन कोडॉन को स्टॉप कोडॉन में बदलकर प्रोटीन छोटा कर देता है। फ़्रेमशिफ़्ट, यानी ऐसी संख्या में क्षार जोड़ना या हटाना जो तीन का गुणज न हो, उसके बाद के हर कोडॉन को बदल देता है। मौन उत्परिवर्तन एक कोडॉन को उसी अमीनो अम्ल के दूसरे कोडॉन से बदलता है।

सिकल सेल उत्परिवर्तन कोडॉन 7 पर है तो इसे Glu6Val क्यों कहते हैं?

परंपरा से हीमोग्लोबिन की स्थितियाँ तैयार शृंखला के पहले अमीनो अम्ल से गिनी जाती हैं, यानी शुरुआती मेथियोनीन हटने के बाद। यह सिमुलेशन मेथियोनीन से गिनता है, इसलिए वही बदलाव E7V के रूप में दिखता है।

यह कहता है कि WebGL बंद है।

3D दृश्य के लिए WebGL चाहिए, जो हर आधुनिक ब्राउज़र में होता है। ब्राउज़र सेटिंग में हार्डवेयर एक्सेलरेशन बंद होने या बहुत पुराने ग्राफ़िक्स ड्राइवर से यह बंद हो सकता है। हार्डवेयर एक्सेलरेशन चालू करें या दूसरा ब्राउज़र आज़माएँ।

क्या कुछ अपलोड होता है?

नहीं। सिमुलेशन आपका अपना ब्राउज़र WebGL से बनाता है; कहीं कुछ नहीं भेजा जाता, और पेज लोड होने के बाद यह ऑफ़लाइन भी चलता रहता है।