MOI ne demek
Enfeksiyon çokluğu (MOI), hücre başına eklenen enfeksiyöz virüs parçacığı sayısıdır. 200.000 hücrede MOI 5, 1.000.000 enfeksiyöz birim eklemek demektir.
Formül
Virüs hacmi (mL) = MOI × hücre sayısı ÷ titre (mL başına enfeksiyöz birim)
mL başına 1 × 108 titreyle MOI 5’te 200.000 hücre için: 5 × 200.000 ÷ 108 = 0,01 mL = 10 µL.
Hücreler ekimden sonra bölünmeye devam ettiği için onları enfeksiyon günü say ve virüsün enfekte etme biçimine göre ölçülmüş bir titre kullan (plak oluşturan virüsler için PFU, lentivirüs için transdüksiyon birimi). Genom kopyası ya da p24 gibi fiziksel titreler enfeksiyöz olmayan parçacıkları da sayar ve enfeksiyöz dozu olduğundan büyük gösterir.
Kaç hücre enfekte olur
Virüs parçacıkları hücrelere rastgele düşer; bu Poisson dağılımını izler. En az bir kez enfekte olan hücrelerin payı 1 − e−MOI’dir:
- MOI 0,1: hücrelerin yaklaşık %10’u
- MOI 1: yaklaşık %63
- MOI 3: yaklaşık %95
- MOI 5: yaklaşık %99
Yani MOI 1 her hücreyi enfekte etmez; neredeyse hepsine ulaşmak MOI 3–5 ister.
Hangi MOI kullanılmalı
- Neredeyse her hücreyi enfekte etmek için, tek basamaklı büyüme eğrisi gibi: MOI 3–10.
- Havuzlanmış kütüphane taramaları için, her hücre tek bir yapı taşımalıyken: yaklaşık 0,3; böylece hücrelerin yalnızca yaklaşık dörtte biri enfekte olur ama bunların yaklaşık %86’sı tek bir kopya alır.
- Çok basamaklı büyüme eğrileri için, virüs kültür boyunca yayılırken: 0,01–0,1.
Hesaplayıcılar
MOI hesaplayıcı bir MOI için virüs hacmini ya da bir hacim için MOI’yi, beklenen enfekte hücre payıyla birlikte verir. Önce hücrelerini saymak için Hemositometre hesaplayıcıyı kullan.