تقدير حجم حزمة في الهلام
كيف تقدّر حجم حزمة في هلام
- قِس المسافة التي قطعتها كل حزمة من السلّم من البئر، بالمليمترات على نسخة مطبوعة أو بالبكسلات على صورة، واكتب الأحجام مع مسافاتها.
- قِس حزمك بالطريقة نفسها واكتب مسافاتها.
- يُقرأ حجم كل حزمة من المنحنى الملائم، مع R² للملاءمة.
الأسئلة الشائعة
كيف تعمل الملاءمة؟
يتحرك DNA بسرعة تقل مع لوغاريتم طوله، فخط مستقيم لـ log10(الحجم) مقابل المسافة يصف معظم الهلام جيدًا. والملاءمة المنحنية تضيف حدًا تربيعيًا يتبع الانحناءات في بداية الهلام ونهايته.
من أين أقيس؟
من النقطة نفسها في كل الحزم، عادةً الحافة الأمامية، مقيسة من أسفل البئر. الخلط بين حافة حزمة ومركز أخرى هو أكبر مصدر للخطأ.
هل يمكنني القياس بالبكسلات؟
نعم. لا تحتاج الملاءمة إلا أن يكون السلّم وحزمك مقيسة بالوحدة نفسها، فالبكسلات في صورة الهلام تصلح كالمليمترات في نسخة مطبوعة. تأكد من أن الصورة ملتقطة من الأمام، لا بزاوية.
ما مدى دقتها؟
داخل مدى السلّم، عادةً بين 5% و10%. وخارجه تكون الملاءمة استقراءً وقد تخطئ كثيرًا، ولذلك يظهر تحذير حين تقطع حزمة مسافة أبعد من أصغر حزمة في السلّم.
لماذا R² منخفض لديّ؟
إما أن مسافة كُتبت خطأً، أو أن الهلام جرى مائلًا أو بشكل ابتسامة، أو أن أحجام السلّم ليست أحجام السلّم الذي حمّلته. انظر أولًا إلى الطرفين؛ فهما الأكثر تأثيرًا في الملاءمة.
ما أحجام السلّم التي أكتبها؟
التي على الأنبوب. يوجد افتراضيًا سلّم 1 kb معتاد، لكن السلالم تختلف حسب المورد، فانسخ الأحجام من ورقة منتجك.