محتوى GC
محتوى GC هو نسبة القواعد التي هي G أو C: (G + C) ÷ الطول. ATGCGC فيه 4 من 6، أي 66.7%. لأزواج G–C ثلاث روابط هيدروجينية بدلًا من اثنتين، فينفصل DNA الغني بـ GC عند حرارة أعلى، وهذا مهم لبادئات PCR ومجساته. تعطي إحصاءات DNA عدد القواعد ومحتوى GC وAT وثنائيات النيوكليوتيدات.
الوزن الجزيئي
تقدير سريع لـ DNA مزدوج السلسلة نحو 650 دالتون لكل زوج قواعد، وللبروتينات نحو 110 دالتون لكل حمض أميني. أما أداتا الوزن الجزيئي لـ DNA والوزن الجزيئي للبروتين فتجمعان الكتلة الدقيقة لكل قاعدة أو بقية.
نقطة التعادل الكهربائي
نقطة التعادل الكهربائي (pI) هي قيمة pH التي لا يحمل عندها البروتين شحنة صافية. تُقدَّر من عدد البقايا الحمضية والقاعدية وpKa كل منها. مجموعات مختلفة من قيم pKa تعطي نتائج تختلف ببضعة أعشار، فاعتبرها إرشادًا، مثلًا عند اختيار محلول منظِّم لكروماتوغرافيا التبادل الأيوني. وتعطي نقطة التعادل الكهربائي للبروتين أيضًا الشحنة عند أي pH.
GRAVY
المتوسط العام لنفور الماء هو متوسط قيم نفور الماء لـ Kyte–Doolittle لكل البقايا. القيم الموجبة تدل على بروتين كاره للماء إجمالًا والسالبة على بروتين محب للماء؛ وبروتينات الأغشية تسجل عادةً أعلى من الذائبة. وتعطي GRAVY للبروتين أيضًا قيمة نفور الماء لكل نافذة على طول التسلسل، حيث قد تدل مقاطع من نحو 20 بقية كارهة للماء على حلزونات عابرة للغشاء.
جزر CpG
جزر CpG مقاطع غنية بثنائيات CG، غالبًا قرب محفزات الجينات في الفقاريات. تعريف شائع هو نافذة من 200 قاعدة على الأقل بمحتوى GC يتجاوز 50% ونسبة CpG المرصودة إلى المتوقعة تتجاوز 0.6؛ ويستخدم باحث جزر CpG هذه القيم افتراضيًا.
استخدام الكودونات
لمعظم الأحماض الأمينية عدة كودونات، ويفضل كل كائن بعضها على بعض. يبين جدول استخدام الكودونات تكرار استخدام كل منها، لكل ألف كودون وكنسبة بين مرادفاتها، وهذا يساعد على تكييف جين للتعبير عنه في كائن آخر. انظر استخدام الكودونات، وإحصاءات البروتين لتركيب الأحماض الأمينية.