Сводка рестрикции
Как найти ферменты, которые режут вашу ДНК
- Вставьте последовательность ДНК простым текстом или в формате FASTA.
- Выберите, какие ферменты показывать: все режущие, режущие один или два раза или не режущие. Отметьте «Кольцевая ДНК» для плазмиды.
- Каждый фермент выводится с сайтом, числом разрезов, позициями разрезов и размерами фрагментов.
Частые вопросы
Какие ферменты включены?
Набор из 65 распространённых коммерческих ферментов с палиндромными сайтами, например EcoRI, BamHI, HindIII, NotI и XhoI.
Где позиция разреза?
Позиция последнего основания перед разрезом на верхней цепи.
Мои последовательности загружаются на сервер?
Нет. Всё работает в браузере, поэтому последовательности не покидают устройство.
Ещё инструменты для последовательностей ДНК и белков
Обратный комплементДНК в РНКОбъединение последовательностей FASTAРазделение последовательности FASTAGenBank в FASTAEMBL в FASTAИзвлечение элементов GenBankИзвлечение элементов EMBLИзвлечение трансляций GenBankИзвлечение трансляций EMBLРазбиение на кодоныИзвлечение участков ДНКИзвлечение участков белкаСкользящее окно ДНКСкользящее окно белкаОчистка ДНКОчистка белкаГруппировка ДНКГруппировка белкаОднобуквенные коды аминокислот в трёхбуквенныеТрёхбуквенные коды аминокислот в однобуквенныеСтатистика ДНКСтатистика белкаЧастота использования кодоновПоиск CpG-островковМолекулярная масса ДНКМолекулярная масса белкаИзоэлектрическая точка белкаGRAVY белкаПоиск мотива в ДНКПоиск мотива в белкеНечёткий поиск в ДНКНечёткий поиск в белкеИдентичность и сходствоПоиск ORFТрансляция ДНК в белокОбратная трансляцияОбратная трансляция белкового выравниванияАнализ праймеров ПЦРПродукты ПЦРМутации для рестрикцииПарное выравнивание ДНКПарное выравнивание белковПарное выравнивание по кодонамОптимизация кодоновПоиск гидов CRISPRРестрикционная картаКарта трансляцииКарта праймеровРаскраска выравнивания по консервативностиРаскраска выравнивания по свойствамГрафик кодоновПросмотр карты плазмидыСлучайная последовательность ДНКСлучайная белковая последовательностьСлучайная кодирующая ДНКСлучайные участки ДНКСлучайные участки белкаВыборка ДНКВыборка белкаПеремешивание ДНКПеремешивание белкаМутирование ДНКМутирование белкаГенетические кодыКоды IUPAC