Toolyard

Раскраска выравнивания по свойствам


Как раскрасить белковое выравнивание по свойствам

  1. Вставьте белковое выравнивание в формате FASTA с пропусками, записанными как -.
  2. Каждый остаток раскрашивается по своей химии, а легенда находится над выравниванием.
  3. «Скачать» сохраняет раскрашенное выравнивание как веб-страницу.

Частые вопросы

Какие цвета используются?

У гидрофобных (A V L I M F W Y), кислых (D E), основных (K R H), полярных (S T N Q), глицина и пролина и цистеина — свой цвет.

Мои последовательности загружаются на сервер?

Нет. Всё работает в браузере, поэтому последовательности не покидают устройство.

Встроить этот инструмент на свой сайт

Ещё инструменты для последовательностей ДНК и белков

Обратный комплементДНК в РНКОбъединение последовательностей FASTAРазделение последовательности FASTAGenBank в FASTAEMBL в FASTAИзвлечение элементов GenBankИзвлечение элементов EMBLИзвлечение трансляций GenBankИзвлечение трансляций EMBLРазбиение на кодоныИзвлечение участков ДНКИзвлечение участков белкаСкользящее окно ДНКСкользящее окно белкаОчистка ДНКОчистка белкаГруппировка ДНКГруппировка белкаОднобуквенные коды аминокислот в трёхбуквенныеТрёхбуквенные коды аминокислот в однобуквенныеСтатистика ДНКСтатистика белкаЧастота использования кодоновПоиск CpG-островковМолекулярная масса ДНКМолекулярная масса белкаИзоэлектрическая точка белкаGRAVY белкаПоиск мотива в ДНКПоиск мотива в белкеНечёткий поиск в ДНКНечёткий поиск в белкеИдентичность и сходствоПоиск ORFТрансляция ДНК в белокОбратная трансляцияОбратная трансляция белкового выравниванияАнализ праймеров ПЦРПродукты ПЦРСводка рестрикцииМутации для рестрикцииПарное выравнивание ДНКПарное выравнивание белковПарное выравнивание по кодонамОптимизация кодоновПоиск гидов CRISPRРестрикционная картаКарта трансляцииКарта праймеровРаскраска выравнивания по консервативностиГрафик кодоновПросмотр карты плазмидыСлучайная последовательность ДНКСлучайная белковая последовательностьСлучайная кодирующая ДНКСлучайные участки ДНКСлучайные участки белкаВыборка ДНКВыборка белкаПеремешивание ДНКПеремешивание белкаМутирование ДНКМутирование белкаГенетические кодыКоды IUPAC