Коды IUPAC
Нуклеотиды
| Код | Основания | Значение |
| A | A | Аденин |
| C | C | Цитозин |
| G | G | Гуанин |
| T | T | Тимин |
| U | U | Урацил |
| R | A или G | Пурин |
| Y | C или T | Пиримидин |
| S | G или C | Сильные |
| W | A или T | Слабые |
| K | G или T | Кето |
| M | A или C | Аминогруппа |
| B | C, G или T | Не A |
| D | A, G или T | Не C |
| H | A, C или T | Не G |
| V | A, C или G | Не T |
| N | A, C, G или T | Любое основание |
| - | Пропуск |
Аминокислоты
| Код | Трёхбуквенный | Название |
| A | Ala | Аланин |
| R | Arg | Аргинин |
| N | Asn | Аспарагин |
| D | Asp | Аспарагиновая кислота |
| C | Cys | Цистеин |
| Q | Gln | Глутамин |
| E | Glu | Глутаминовая кислота |
| G | Gly | Глицин |
| H | His | Гистидин |
| I | Ile | Изолейцин |
| L | Leu | Лейцин |
| K | Lys | Лизин |
| M | Met | Метионин |
| F | Phe | Фенилаланин |
| P | Pro | Пролин |
| S | Ser | Серин |
| T | Thr | Треонин |
| W | Trp | Триптофан |
| Y | Tyr | Тирозин |
| V | Val | Валин |
| U | Sec | Селеноцистеин |
| O | Pyl | Пирролизин |
| B | Asx | Аспарагин или аспарагиновая кислота |
| Z | Glx | Глутамин или глутаминовая кислота |
| J | Xle | Лейцин или изолейцин |
| X | Xaa | Любая аминокислота |
| * | Ter | Стоп |
Как пользоваться: Коды IUPAC
- В первой таблице перечислены коды нуклеотидов и основания, которые обозначает каждый.
- Во второй — коды аминокислот с трёхбуквенными кодами и названиями.
Частые вопросы
Что значит N в последовательности ДНК?
Любое основание: A, C, G или T. Используется там, где основание неизвестно.
Что такое B, Z и J в белке?
B — аспарагин или аспарагиновая кислота, Z — глутамин или глутаминовая кислота, J — лейцин или изолейцин, когда их нельзя различить.
Ещё инструменты для последовательностей ДНК и белков
Обратный комплементДНК в РНКОбъединение последовательностей FASTAРазделение последовательности FASTAGenBank в FASTAEMBL в FASTAИзвлечение элементов GenBankИзвлечение элементов EMBLИзвлечение трансляций GenBankИзвлечение трансляций EMBLРазбиение на кодоныИзвлечение участков ДНКИзвлечение участков белкаСкользящее окно ДНКСкользящее окно белкаОчистка ДНКОчистка белкаГруппировка ДНКГруппировка белкаОднобуквенные коды аминокислот в трёхбуквенныеТрёхбуквенные коды аминокислот в однобуквенныеСтатистика ДНКСтатистика белкаЧастота использования кодоновПоиск CpG-островковМолекулярная масса ДНКМолекулярная масса белкаИзоэлектрическая точка белкаGRAVY белкаПоиск мотива в ДНКПоиск мотива в белкеНечёткий поиск в ДНКНечёткий поиск в белкеИдентичность и сходствоПоиск ORFТрансляция ДНК в белокОбратная трансляцияОбратная трансляция белкового выравниванияАнализ праймеров ПЦРПродукты ПЦРСводка рестрикцииМутации для рестрикцииПарное выравнивание ДНКПарное выравнивание белковПарное выравнивание по кодонамОптимизация кодоновПоиск гидов CRISPRРестрикционная картаКарта трансляцииКарта праймеровРаскраска выравнивания по консервативностиРаскраска выравнивания по свойствамГрафик кодоновПросмотр карты плазмидыСлучайная последовательность ДНКСлучайная белковая последовательностьСлучайная кодирующая ДНКСлучайные участки ДНКСлучайные участки белкаВыборка ДНКВыборка белкаПеремешивание ДНКПеремешивание белкаМутирование ДНКМутирование белкаГенетические коды