Toolyard

Разделение последовательности FASTA

Как разделить последовательность на фрагменты

  1. Вставьте последовательность ДНК или белка или несколько записей FASTA.
  2. Задайте длину фрагмента и, если нужно, чтобы фрагменты имели общие буквы, перекрытие.
  3. Каждый фрагмент становится отдельной записью FASTA с номером и положением в заголовке.

Частые вопросы

Что делает перекрытие?

При длине фрагмента 100 и перекрытии 20 фрагменты покрывают 1..100, 81..180, 161..260 и так далее. Перекрытие должно быть меньше длины фрагмента.

Мои последовательности загружаются на сервер?

Нет. Всё работает в браузере, поэтому последовательности не покидают устройство.

Встроить этот инструмент на свой сайт

Ещё инструменты для последовательностей ДНК и белков

Обратный комплементДНК в РНКОбъединение последовательностей FASTAGenBank в FASTAEMBL в FASTAИзвлечение элементов GenBankИзвлечение элементов EMBLИзвлечение трансляций GenBankИзвлечение трансляций EMBLРазбиение на кодоныИзвлечение участков ДНКИзвлечение участков белкаСкользящее окно ДНКСкользящее окно белкаОчистка ДНКОчистка белкаГруппировка ДНКГруппировка белкаОднобуквенные коды аминокислот в трёхбуквенныеТрёхбуквенные коды аминокислот в однобуквенныеСтатистика ДНКСтатистика белкаЧастота использования кодоновПоиск CpG-островковМолекулярная масса ДНКМолекулярная масса белкаИзоэлектрическая точка белкаGRAVY белкаПоиск мотива в ДНКПоиск мотива в белкеНечёткий поиск в ДНКНечёткий поиск в белкеИдентичность и сходствоПоиск ORFТрансляция ДНК в белокОбратная трансляцияОбратная трансляция белкового выравниванияАнализ праймеров ПЦРПродукты ПЦРСводка рестрикцииМутации для рестрикцииПарное выравнивание ДНКПарное выравнивание белковПарное выравнивание по кодонамОптимизация кодоновПоиск гидов CRISPRРестрикционная картаКарта трансляцииКарта праймеровРаскраска выравнивания по консервативностиРаскраска выравнивания по свойствамГрафик кодоновПросмотр карты плазмидыСлучайная последовательность ДНКСлучайная белковая последовательностьСлучайная кодирующая ДНКСлучайные участки ДНКСлучайные участки белкаВыборка ДНКВыборка белкаПеремешивание ДНКПеремешивание белкаМутирование ДНКМутирование белкаГенетические кодыКоды IUPAC