Toolyard

Раскраска выравнивания по консервативности


Как раскрасить выравнивание по консервативности

  1. Вставьте выравнивание в формате FASTA с пропусками, записанными как -.
  2. Выберите ДНК или белок и долю последовательностей, которые должны совпадать, чтобы столбец был затенён.
  3. Идентичные остатки затеняются тёмно-синим, а у белков сходные — светло-синим. «Скачать» сохраняет раскрашенное выравнивание как веб-страницу.

Частые вопросы

Как вставить его в документ?

Выделите раскрашенное выравнивание на странице и скопируйте; большинство текстовых редакторов сохраняют цвета. Скачанный файл открывается в любом браузере.

Мои последовательности загружаются на сервер?

Нет. Всё работает в браузере, поэтому последовательности не покидают устройство.

Встроить этот инструмент на свой сайт

Ещё инструменты для последовательностей ДНК и белков

Обратный комплементДНК в РНКОбъединение последовательностей FASTAРазделение последовательности FASTAGenBank в FASTAEMBL в FASTAИзвлечение элементов GenBankИзвлечение элементов EMBLИзвлечение трансляций GenBankИзвлечение трансляций EMBLРазбиение на кодоныИзвлечение участков ДНКИзвлечение участков белкаСкользящее окно ДНКСкользящее окно белкаОчистка ДНКОчистка белкаГруппировка ДНКГруппировка белкаОднобуквенные коды аминокислот в трёхбуквенныеТрёхбуквенные коды аминокислот в однобуквенныеСтатистика ДНКСтатистика белкаЧастота использования кодоновПоиск CpG-островковМолекулярная масса ДНКМолекулярная масса белкаИзоэлектрическая точка белкаGRAVY белкаПоиск мотива в ДНКПоиск мотива в белкеНечёткий поиск в ДНКНечёткий поиск в белкеИдентичность и сходствоПоиск ORFТрансляция ДНК в белокОбратная трансляцияОбратная трансляция белкового выравниванияАнализ праймеров ПЦРПродукты ПЦРСводка рестрикцииМутации для рестрикцииПарное выравнивание ДНКПарное выравнивание белковПарное выравнивание по кодонамОптимизация кодоновПоиск гидов CRISPRРестрикционная картаКарта трансляцииКарта праймеровРаскраска выравнивания по свойствамГрафик кодоновПросмотр карты плазмидыСлучайная последовательность ДНКСлучайная белковая последовательностьСлучайная кодирующая ДНКСлучайные участки ДНКСлучайные участки белкаВыборка ДНКВыборка белкаПеремешивание ДНКПеремешивание белкаМутирование ДНКМутирование белкаГенетические кодыКоды IUPAC