Калькулятор агарозного геля

Как рассчитать агарозу для геля

1. Введите концентрацию геля и объём заливаемого геля.
2. Выберите сток буфера и введите крепость красителя ДНК, если добавляете его в гель.
3. Появятся граммы агарозы с буфером и водой для смешивания, объёмом красителя и размерами ДНК, которые лучше всего разделяет эта концентрация.

Частые вопросы

Какая формула?

Процент геля — это граммы на 100 мл, поэтому граммы = % × объём в мл ÷ 100. Для 1% геля объёмом 50 мл нужно 0,5 г агарозы.

Какую концентрацию использовать?

Низкие концентрации разделяют крупную ДНК, высокие — мелкую. Примерно: 0,7% для 0,8–12 т.п.н., 1% для 0,5–10 т.п.н., 1,5% для 0,2–3 т.п.н. и 2% для 50 п.н.–2 т.п.н.

TAE или TBE?

TAE лучше для крупных фрагментов и для вырезания полос из геля; TBE даёт более чёткие полосы мелких фрагментов и лучше выдерживает долгий электрофорез.